قصة استشهاد القس مرقس خليل هو فى طريقه إلى الكنيسة ليصلى القداس
كاهن كنيسة ماربقطر /موشا/اسيوط فى21/6/1991 يوم الجمعة 21 – 6 – 1991 م الموافق 14 بؤونة 1706ش وحوالي الساعة السادسة إلا ربع صباحاً وهو فى طريقه إلى الكنيسة كعادته ليصلى القداس ،
قام جماعة من الغوغاء بضرب القديس بآلة حادة فى رقبته ، وبعصا غليظة على رأسه ، فسقط على الأرض في دمائه ، وأرادوا أن يقدموه ذبيحة حية لدى مخلصنا على المذبح السماوى فسكبوا عليه كيروسين وحاولوا حرقه بالنار وأسرعت الناس ولم يكتمل الأمر، وأراد الله ونال إكليل الشهادة ، وحملت الملائكة روحه الطاهرة إلى أحضان القديسين